Lehr- und Forschungseinheit für Datenbanksysteme Ludwig-Maximilians-Universität München
Institut für Informatik
Lehr- und Forschungseinheit für Datenbanksysteme
University of Munich
Institute for Computer Science
Database and Information Systems

Projekt/Diplomarbeiten im Bereich:

Evaluierung von sequenz-basierten Feature-Räumen zur numerischen Darstellung von Protein-Eigenschaften

Motivation

Die Vorhersage bestimmter Eigenschaften eines Proteins (z.B. Fold-Recognition) kann man als Klassifikations-Problem auffassen. Hierzu wird oft die Aminosäure-Sequenz in einen reell-wertigen Feature-Raum abgebildet. Die Wahl einer geeigneten Abbildung ist entscheidend, um den späteren Erfolg einer im Feature-Raum angewandten Methode (z.B. einer Klassifikations-Methode) zu ermöglichen.
CATH Hierarchie

Aufgabenstellung

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Diverse unterschiedliche Feature-Räume sollen zunächst verglichen und evaluiert werden. Basierend auf den gewonnenen Erkenntnissen lassen sich vielleicht auch neue Feature-Räume und neue Klassifikationsmethoden definieren.

Vorkenntnisse

Ansprechpartner

Dr. Matthias Renz
Raum : E 1.11
Telefon089 / 2180 9331
Mail : renz (at) dbs ifi lmu de
Dr. Arthur Zimek
Raum : E 1.06
Telefon089 / 2180 9325
Mail : zimek (at) dbs ifi lmu de
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